Detalles de la búsqueda
1.
A Pan-cancer Transcriptome Analysis Reveals Pervasive Regulation through Alternative Promoters.
Cell
; 178(6): 1465-1477.e17, 2019 09 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31491388
2.
Species-wide genetic incompatibility analysis identifies immune genes as hot spots of deleterious epistasis.
Cell
; 159(6): 1341-51, 2014 Dec 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25467443
3.
Determination and inference of eukaryotic transcription factor sequence specificity.
Cell
; 158(6): 1431-1443, 2014 Sep 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25215497
4.
Interferon-γ regulates cellular metabolism and mRNA translation to potentiate macrophage activation.
Nat Immunol
; 16(8): 838-849, 2015 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26147685
5.
Aligning distant sequences to graphs using long seed sketches.
Genome Res
; 33(7): 1208-1217, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37072187
6.
Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport.
Nat Methods
; 20(11): 1759-1768, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37770709
7.
Genomic basis for RNA alterations in cancer.
Nature
; 578(7793): 129-136, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32025019
8.
Lossless indexing with counting de Bruijn graphs.
Genome Res
; 2022 May 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35609994
9.
SimReadUntil for benchmarking selective sequencing algorithms on ONT devices.
Bioinformatics
; 40(5)2024 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38603597
10.
ResMiCo: Increasing the quality of metagenome-assembled genomes with deep learning.
PLoS Comput Biol
; 19(5): e1011001, 2023 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37126495
11.
A Rapid Translational Immune Response Program in CD8 Memory T Lymphocytes.
J Immunol
; 209(6): 1189-1199, 2022 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36002234
12.
Author Correction: Genomic basis for RNA alterations in cancer.
Nature
; 614(7948): E37, 2023 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36697831
13.
PipeIT2: A tumor-only somatic variant calling workflow for molecular diagnostic Ion Torrent sequencing data.
Genomics
; 115(2): 110587, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36796655
14.
SECEDO: SNV-based subclone detection using ultra-low coverage single-cell DNA sequencing.
Bioinformatics
; 38(18): 4293-4300, 2022 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35900151
15.
Topology-based sparsification of graph annotations.
Bioinformatics
; 37(Suppl_1): i169-i176, 2021 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34252940
16.
Reconstructing tumor evolutionary histories and clone trees in polynomial-time with SubMARine.
PLoS Comput Biol
; 17(1): e1008400, 2021 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33465079
17.
Identification of HIF-dependent alternative splicing in gastrointestinal cancers and characterization of a long, coding isoform of SLC35A3.
Genomics
; 113(2): 515-529, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33418078
18.
Author Correction: Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport.
Nat Methods
; 20(11): 1830, 2023 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37903912
19.
Mutational signature learning with supervised negative binomial non-negative matrix factorization.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i154-i160, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657388
20.
SCIM: universal single-cell matching with unpaired feature sets.
Bioinformatics
; 36(Suppl_2): i919-i927, 2020 12 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33381818